ยีนที่สำคัญ ซึ่งรวมถึงการเข้าถึง 11,500 รายการของทั้งถั่วทั่วไปและถั่วรองชนะเลิศ ได้เริ่มต้นขึ้นแล้ว จะใช้เทคนิคการจัดลำดับจีโนไทป์ ซึ่งเป็นขั้นตอนที่ระบุความหลากหลายเนื่องจากความแตกต่างของนิวคลีโอไทด์เดี่ยว (เช่น เครื่องหมายแสดงความแตกต่างของนิวคลีโอไทด์เดี่ยว) ซึ่งปัจจุบันเป็นเครื่องมือสำคัญสำหรับการวิเคราะห์ทางพันธุกรรม สิ่งนี้ช่วยให้คำจำกัดความของโครงสร้างประชากรของ
สปีชีส์เหล่านี้ และจัดเตรียมส่วนย่อย
ของจีโนไทป์สำหรับการสร้างฟีโนไทป์และสำหรับลักษณะจีโนมที่ลึกยิ่งขึ้น การถอดรหัส และเมแทบอโลมิกจะใช้วิธีการแบบสหสาขาวิชาชีพ รวมทั้งจีโนมิกส์ (เช่น การจัดลำดับจีโนมและทรานสคริปโตมทั้งหมด เทคนิคการหาลำดับอาร์เอ็นเอ) ประชากร/พันธุศาสตร์เชิงปริมาณ ชีวเคมี และสรีรวิทยาของพืช ในการระบุยีนและเมแทบอไลต์ที่เกี่ยวข้องกับการปรับตัว เราจะใช้การวิเคราะห์
การแสดงออกที่แตกต่างกัน
การวิเคราะห์รูปแบบการแสดงออกร่วม และการศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนม ข้อมูลจีโนไทป์ที่ได้รับจากการจัดลำดับจีโนม การหาลำดับจีโนมทั้งหมด และการจัดลำดับอาร์เอ็นเอจะถูกใช้เพื่อทดสอบลายเซ็นของการคัดเลือกและระบุบริเวณของจีโนมที่เกี่ยวข้องกับลักษณะทางพืชไร่ที่ปรับตัวได้และสำคัญ (เช่น เวลาออกดอก ความไวต่อช่วงแสง ผลผลิต , และคนอื่น ๆ).
สิ่งสำคัญอีกประการหนึ่งของโครงการ
BEAN_ADAPT คือการส่งเสริมการใช้ทรัพยากรพันธุกรรมพืช Phaseolus อย่างมีประสิทธิภาพผ่านการพัฒนาระบบข้อมูลแบบบูรณาการ สิ่งนี้จะเชื่อมโยงกับการจัดการธนาคารยีนและปรับปรุงโดยการพัฒนาและลักษณะของสายบริสุทธิ์ 10,000 P. vulgaris ซึ่งส่วนหนึ่งจะได้รับการตรวจสอบอย่างลึกซึ้งโดยการจัดลำดับจีโนมทั้งหมด การวิเคราะห์ทรานสคริปโตมและเมตาโบโลม และ
ลักษณะของฟีโนไทป์
BEAN_ADAPT จะพัฒนาระบบข้อมูลแบบครบวงจรซึ่งจะรวมข้อมูลจำนวนมหาศาลที่สร้างขึ้นภายในโครงการ เชื่อมโยงข้อมูลจีโนมกับข้อมูลเกี่ยวกับทรัพยากรพันธุกรรมพืช สิ่งนี้จะอำนวยความสะดวกในการแบ่งปันข้อมูลด้วยการเชื่อมต่อข้อมูลกับ European Genetic Resources Search Catalog (EURISCO)สมาคม BEAN_ADAPTการผสานรวมความเชี่ยวชาญประเภทต่างๆ ผ่าน
การผสมผสานเครื่องมือใหม่ทั้งหมด
ของจีโนมิกส์ พร้อมด้วยฟีโนไทป์ระดับโมเลกุลและมาตรฐาน เป็นพื้นฐานสำคัญของกิจกรรมของโครงการ ความร่วมมือ BEAN_ADAPT เกี่ยวข้องกับกลุ่มวิจัย 5 กลุ่มของสถาบันและมหาวิทยาลัยสาธารณะในยุโรปและอเมริกา ซึ่งมีความเชี่ยวชาญเฉพาะด้านและเสริมกันอย่างมากในสาขาต่างๆ ของวิทยาศาสตร์พืช สิ่งเหล่านี้รวมถึงจีโนมิกส์ ชีวสารสนเทศ เมแทบอโลมิกส์ เทคโนโลยี
การสร้างฟีโนไทป์ระดับโมเลกุลใหม่
การทดลองภาคสนาม การปรับปรุงพันธุ์พืช การใช้จีโนมของประชากร การวิเคราะห์กระบวนการวิวัฒนาการ นอกเหนือไปจากการรวบรวมเฟสโอลัสที่ใหญ่ที่สุดในยุโรปกลุ่มวิจัยจากองค์กรในยุโรปสามแห่งและมหาวิทยาลัยในสหรัฐอเมริกาสองแห่งรวมกันเป็นสมาคมนี้ และรวมถึงสิ่งต่อไปนี้:
Credit : สล็อต
